Położona w mieście Jardim, około 52 km od miasta Bonito , Lagoa Misteriosa znajduje się na dnie zapadliska, rodzaju formacji geologicznej, podobnej do głębokiej dziury. Jest to siódma pod względem głębokości jaskinia Brazylijskiego Towarzystwa Speleologii i ma ponad 220 metrów głębokości.
Krajobraz tworzą pionowe ściany skalne, zwalony pień i małe rybki lśnią pod wiązką światła, odbijając się w przezroczystej wodzie, która czyni lagunę wyjątkowym środowiskiem.
Wycieczka rozpoczyna się szlakiem do punktu widokowego laguny, gdzie można się wahać lub nurkować. Wycieczka prowadzi do lasu łęgowego rzeki Prata, gdzie można rozkoszować się kąpielą rzeczną na krystalicznej wodzie i pięknym wiosennym widokiem. Dostępne są również wycieczki statkiem.
Lagoa Misteriosa jest otwarta od maja do września. Od października do kwietnia glony powierzchniowe formują się na głębokości do 15 metrów, dostępnych dla zawodowych nurków.